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  • 基于《药物不良反应杂志》病例报告数据集的语义信息检索研究
    肖雅艺, 雷毅, 王欣, 白向荣, 张青霞, 费晓璐
    药物不良反应杂志. 2024, 26(3): 170-177. https://doi.org/10.3760/cma.j.cn114015-20230920-00691
    摘要 (195) PDF (94) 可视化 收藏
    目的 基于《药物不良反应杂志》病例报告数据集，探索语义信息检索（语义检索）的应用价值。　方法 本研究所用数据集由《药物不良反应杂志》1999至2022年发表的共计2-597篇病例报告的PDF文件构成。语义检索系统基于百度飞浆（PaddlePaddle）的深度学习框架搭建，代码用Python语言书写，文本编码模型为百度RocketQA模型。采用排名前k位文档的精确率（P@k）、召回率（R@k）、平均排序倒数（MRR）、平均精度均值（MAP）及精确率-召回率（P-R）曲线对语义检索的效果进行评价。本研究通过计算语义检索和关键词匹配检索的召回率，对2种方式的检索效果进行比较。　结果 预处理后题目字段作为待检索对象（item）的集合包含2-597个文档；去重整理后检索词（query）的集合包含药品名称1-388条，不良反应/事件1-118条。以药品名称和不良反应/事件为检索词进行语义检索的精确率分别为0.667~1和0.566~1，召回率分别为0.667~0.871和0.566~0.863；采用药品名称和不良反应/事件检索词进行语义检索结果中排名前1、3、5和10文档的P-R曲线显示，随着召回率的升高，排名前1、3的精确率下降趋势较缓，排名前5、10的精确率下降趋势明显。2类检索词的MRR分别为0.854和0.871，MAP分别为0.778和0.773。以不良反应/事件为检索词，语义检索的召回率高于关键词匹配检索；以药品名称为检索词，关键词匹配检索的召回率总体高于语义检索。　结论 基于百度飞浆深度学习框架搭建的语义检索系统对于《药物不良反应杂志》病例报告数据集的检索性能良好。语义检索与关键词匹配检索相比，以不良反应/事件为检索词时语义检索的检索效果较好，以药品名称为检索词时关键词匹配检索效果较好。
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版权信息

出版单位：药物不良反应杂志社

主办单位：中华医学会

国际刊号：ISSN 1008-5734

国内刊号：CN 11-4015/R

地址：北京市西城区广安门内大街118号院东华金座宣武医院教学楼1089室

邮编：100053

电话：15611475509

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